刘粹本想趁胜登陆追击，司马楚之命弓箭手沿河岸排开，严阵以待；夯台上的投石如雨，急弩响个不停。
仓促间难以登岸，刘粹索性下令焚毁雍军水寨，率水师在江上追击雍军逃船。
雍军水师船只大半被毁，剩下的船只停靠在岸边，不敢出战。司马楚之下令剩余的船只退入夷水之中，在周翔的引领下到其原来的巴山水寨暂驻。
北门外的营寨没有放弃，司马楚之以夯台为据点，两千兵马驻守城外，在江岸处遍设木栅防止宋船登陆。
水寨已失，与江北的联系被截断，夷道城成为孤城。
不过，司马楚之并不慌乱，他知道主公正与刘裕在江陵交战，只要江陵城被主公夺取，夷道之围立时迎刃而解。
夷道城城池坚固，城中储粮足够半年之用，城中有驻军万余，宋军若无五万之数，司马楚之自信能够坚守。当年刘备在此大败而归，自己只需遵照主公之命守牢夷道城，钉在长江南岸，便是大功一件。
刘粹破夷道水寨之后，顺流前往刘裕营寨拜见主公。刘裕得知夷道水师已破，江上道路畅通，当即命北岸兵马乘船过江。
五月十二日，刘裕大军过江，在夷道城东立营，刘裕加上沈林子兵马共一万三千人，南门有刘康祖的五千兵马，司马楚之决定放弃北城营寨，将二千将士招入城中，倚城而守。
江北岸，张锋见刘裕大军围困夷道城，但没有战船只能眼睁睁地干着急。江上有刘裕水师来回巡游，光靠自己搜罗来的数十条渔船根本不可能顺利渡江。
垫江船场建造的战舰不多，江阳城檀道济还有一部分水师，朱超石不可能派舰队前来增援夷道城。何况从垫江前往夷道，千里迢迢，其间要经过鱼复、秭归、夷陵等城，远水解不了近渴。
张锋派信使急报纪南城的杨安玄，请主公定夺。杨安玄亦感无奈，汉江与长江之间最短水路，只有通过扬口入扬水抵达长江，要想从水路
支持夷道，唯有夺取江陵城。
欲取江陵，必先夺纪南，五月十六日，杨安玄率军从北、东两面开始攻城。
纪南城地势较低，杨安玄下令投石车推至城墙一百五十步处，投石车将石块雨点般地向纪南城投去。
起初，城头悬牛皮幔遮挡飞石，待投石一个时辰后，城头的牛皮幔尽毁，不少石块越过城墙，朝着城中飞去，将屋舍砸得瓦破檐断、墙壁倒塌。
城中百姓或到墙根下，或往城中躲避石雨，苦不堪言。
杨安玄没有急于攻城，而是每天投石大半个时辰，然后让兵丁虚张声势地进攻，又在西城起疑兵，夜间燃起火把，鼓噪佯攻。
五天下来，城中守军和百姓都疲惫不堪，刘钟就宿在城墙根下，听到雍军发出声响，随时上城鼓舞士气。
此次攻打江陵，杨安玄带来了三万斤火药，攻打姚秦的时候能够震塌峣关，相信纪南城也会在火药的威力下沦落。
同样是夜间鼓噪，城头的守军在刘钟的催促下却显得有些懒洋洋，城下雍军火把虽多，却是一人持双火把，轒辒车的两旁也插满了火把，分明是虚张声势。
刘钟不解杨安玄的用意，但他知道杨安玄不会无的放矢，这样做一定有其用意所在。
不过，无论是疲兵之计还是想诱自己出战，刘钟都决定以不变应万变，只要自己坚守不出，杨安玄能奈我何。
又过了三个晚上，城头守军已经习惯了雍军的夜攻，每日子时到寅末，有时在北，有时在东，偶尔也会在西城。刘钟不敢有丝毫大意，哪怕是从未有过雍军出现的东城也让兵丁严加戒备。
城头守军疲于奔走，却不知这些天雍军已在纪南城北面的城墙上挖出八个深三尺、高五尺的大洞，彼此相隔不过两丈远。
五月二十五日，借着夜色的掩护，雍军一面鼓噪着吸引城上守军注意力，一面悄然将用罐密封好的火药被塞到了窟窿中。
为了增进火药的爆炸力，军械司在杨安玄的提示下，严格遵照硝石、硫磺、木炭配比，将其他杂物摒弃。
为达到最大爆炸的威力，颗粒化黑火药提上了日程，杨安玄让收集尿液将硝石等物搅拌晾干，然后碾成小颗粒，这样火药的颗粒化便完成了。
工匠们试爆这种带着异味的火药，惊喜地发现爆炸的威力比起以前翻了倍，足以开山裂石。
在峣关下用竹筒装填火药的模式被杨安玄所摒弃，须知黑火药密封的效果越好、壳体强度越大，爆炸的威力越强。
杨安玄专门命陶瓦匠人生产了一批肚大口小的瓦罐，用来装填火药，开口处用油纸密封，只留引线。
卯初，俞飞过来禀报，火药装填完毕。此时，天边开始泛出鱼肚白，杨安玄看了一眼黑沉沉的纪南城。
纪南城是夯土所筑，在八千斤火药的爆炸下，这座雄城还能安然不动吗？火药的出现，已经改变了过去的攻城方式，一个崭新的时代会随着震天巨响到来。