中华总商会的这一系列行为，也引发了江南盐商会以及徽、晋、陕、鲁、闽、粤、宁波、洞庭、江右、龙游等十余家大型商会的联手抵制。
就在各地商会与当地官府勾结，准备对中华总商会采取反制措施的时候，各地的官府衙门、功勋贵族、达官显要们，却纷纷遭到锦衣卫和东厂厂公的联合“拜访”。
明确言明中华总商会，乃是大明国内唯一一家，经过朝廷中枢备案并依法纳税的合法组织，朝廷下辖的各个官府衙门都必须予以保护。
各地商会和官员们在面对利益流失时，并没有向锦衣卫和东厂厂公屈服。纷纷通过他们在北京朝廷中的代言人，竟然公然在奉天殿举行的大朝会上，集体向崇祯皇帝提出了控诉。
然而这一次，崇祯皇帝却一反常态，没有像以往那样采取怀柔策略，而是直接在大朝会上拍案而起。
将那些公然跳出来反对，以及质疑中华总商会的臣工们，处以罚俸半年的处罚，并逐一实施廷杖之刑。
崇祯皇帝怒斥这些臣工浑身散发着铜臭味，竟然将商人的市井伎俩，公然当作国家大事在朝会上讨论，实在是让人无法容忍。
与此同时，少数几位支持中华总商会，倡导规范大明国商业环境，鼓励商人依法缴纳商税，积极稳定民间物价的官员。
虽然在大朝会上也受到了责备，但并未遭受到任何实质性的惩处。这无疑就表明了崇祯对待此事的鲜明立场。
紧随其后的便是锦衣卫北镇抚司，迅速派出了大量锦衣卫，前往那些遭受廷杖的官员家中了解情况。
向那些跳出来反对中华总商会的官员们，十分郑重的传达了崇祯的口谕：
“朕，对官商勾结的恶劣行径深恶痛绝！
尔等若是再敢提及此事，锦衣卫就会派出侦骑查办贪腐。”
由于崇祯皇帝的强硬态度，这场原本发生在商人之间的争执纠纷，刚刚露出些许苗头，便被毫不留情的扼杀于萌芽状态。
那些嗅觉敏锐、消息灵通的商人们，纷纷想方设法通过各种渠道，去打探中华总商会的背景靠山，但结果却都是一无所获。
他们仅仅知道，在中华总商会的背后，有一股极为强大的力量作为支撑，但具体是何方神圣在给予支持，却是众说纷纭，没有一个确切的答案。
人们所能联想到的，无非就是大明朝廷中的那些功臣勋贵，或者是某位不安分的朱姓王爷，然而，却没有人将中华总商会与皇室联系起来。
毕竟，自从明太祖朱元璋起，对于商人追逐利益的行为，一直持鄙夷态度，历代皇帝更是采取了极其严厉的打压政策。
商人的地位在士、农、工、商中处于四民之末，甚至比人数众多的农户还要低贱。
而且，商人的权力还遭受到各种限制，比如禁止参加科举、禁止被举荐入仕、禁止穿丝绸锦缎、禁止骑马招摇过市。
在知道中华总商会根基深厚，很可能会一枝独秀后，大明国各地的商人就都涌向了南京城，希望能早日享受到中华总商会带来的营商便利。
然而，当他们来到中华总商会门口，看到张贴出来的各项规章制度时，心中又涌起了难以接受的抵触情绪，仿佛被一盆冷水当头泼下。
中华总商会规定所有入会的商人，每年必须按时、足额的向朝廷缴纳各种税款。