马戏团成功解散后，动物们都回到了森林。可没过多久，森林里来了一群神秘的机械猎人。他们装备精良，所到之处动物们纷纷逃窜。熊大、熊二带着大家一起想办法对抗这些机械猎人。
一次偶然的机会，他们发现机械猎人的操控中心在森林边缘的一座废弃工厂。于是，熊大带着动物们组成了一支特别行动队，准备潜入工厂捣毁操控中心。在潜入过程中，他们遭遇了重重机关和机械守卫，但凭借着大家的智慧和勇气，一次次化险为夷。
终于，他们来到了操控中心。可就在要成功摧毁时，机械猎人的首领出现了，他竟是被马戏团老板改造后的天才科学家。一场激烈的对决展开，熊大他们能否凭借团结的力量战胜强大的敌人，让森林重新恢复往日的宁静，一切还是未知数。
天才科学家冷笑一声，操控着身边的机械守卫向熊大他们扑来。机械守卫们力大无穷，动物们一时间有些招架不住。熊大一边躲避攻击，一边观察着科学家的弱点。突然，他发现科学家身后的控制台上有一个闪烁的核心装置，那似乎就是控制所有机械的关键。
熊大当机立断，招呼熊二和其他动物们分散科学家的注意力，自己则瞅准时机，一个箭步冲向控制台。就在他快要接近核心装置时，科学家察觉到了他的意图，急忙发射出一道强力激光。熊大灵活地侧身躲开，继续向前。
终于，熊大成功地拔掉了核心装置。瞬间，所有的机械守卫都停止了运作。科学家瞪大了眼睛，不敢相信眼前的一切。失去了机械的保护，他显得那么渺小。动物们一拥而上，将他制服。
森林又恢复了往日的宁静，动物们欢呼雀跃，他们用团结和智慧战胜了强大的敌人，守护住了自己的家园。
然而，就在大家沉浸在胜利喜悦中时，被制服的科学家发出了诡异的笑声。“你们以为这样就结束了？这只是个开始！”话音刚落，地面突然剧烈震动，从地下钻出了一个巨大的超级机械兽。这机械兽全身散发着冰冷的蓝光，每一步都让大地颤抖。动物们的欢呼声戛然而止，取而代之的是紧张的沉默。
熊大深吸一口气，再次组织大家。他让猴子们利用灵活的身手去破坏机械兽的关节，让鸟儿们从空中干扰它的视线，自己和熊二则合力攻击机械兽的头部。动物们各司其职，与超级机械兽展开了又一场激烈战斗。在一次次的攻击与躲避中，动物们逐渐找到了超级机械兽的弱点。最终，在大家的齐心协力下，超级机械兽轰然倒地。森林彻底恢复了平静，动物们明白了，守护家园的道路也许会充满挑战，但只要团结一心，就没有战胜不了的困难。
本以为超级机械兽倒下后，一切真的结束了。可就在这时，天边突然出现一道奇异的光芒，一艘巨大的外星飞船缓缓降临在森林上空。从飞船里走出一群模样怪异的外星生物，它们的身体闪烁着金属光泽，手中拿着比机械猎人更先进的武器。原来，科学家与外星生物勾结，他之前的行动只是在为外星生物探查地球生物的实力。
熊大看着这群新的敌人，心中有些沉重，但他没有退缩。他再次鼓舞动物们，“伙伴们，我们已经战胜过强大的敌人，这次也一定可以！”动物们听后，重新振作起来。它们根据外星生物的特点，迅速制定新的作战计划。鸟儿们用尖喙去攻击外星生物的眼睛，兔子们利用速度引开它们的火力，熊大、熊二则带着大象等力量型动物正面冲锋。在激烈的战斗中，动物们发挥各自的优势，与外星生物展开殊死搏斗。最终，在大家的共同努力下，外星生物被击退，飞船也消失在了天边。森林真正迎来了长久的宁静。
森林恢复平静没多久，一场神秘的瘟疫突然在动物间蔓延开来。患病的动物们浑身无力，毛发脱落，生命垂危。熊大他们四处寻找解决办法，却一无所获。就在大家绝望之时，一只从远方而来的神秘候鸟带来消息，原来这场瘟疫是外星生物临走前留下的报复手段，解药在遥远的雪山之巅。
熊大、熊二毫不犹豫地踏上寻找解药的征程。一路上，他们遭遇了恶劣的天气、凶猛的野兽，但都咬牙坚持。终于，他们登上雪山，找到了藏有解药的洞穴。然而，洞穴里布满了外星生物设下的机关。熊大、熊二凭借着智慧和勇气，一次次化险为夷，拿到了解药。
回到森林，他们立刻为患病的动物们治疗。在解药的作用下，动物们逐渐康复。森林又恢复了生机，大家明白了，守护家园不仅要有勇气对抗外敌，还要有面对各种危机的准备。从此，动物们更加团结，共同守护着这片美丽的森林。
森林恢复生机后，平静的日子没过多久。一天夜里，森林深处突然传来阵阵诡异的声响，像是有无数双眼睛在黑暗中窥视。熊大、熊二带着动物们前去查看，发现森林里出现了一种神秘的黑色雾气，所到之处树木枯萎，花草凋零。动物们只要吸入一点雾气，就会变得疯狂暴躁。
熊大猜测这或许又是外星生物的阴谋。他们四处打听，得知在森林的古老传说中，有一处神秘之地能净化一切邪恶。于是，熊大、熊二再次带领大家出发寻找。一路上，他们不仅要躲避黑色雾气的侵袭，还要应对被雾气控制的动物的攻击。