平定了金县之乱，卫所兵在附近扫荡一番，又抓到了几个不辩方向躲藏民间的逃兵。等到杨肇基亲自领着边军赶到，这场乱子彻底平了下去，被抓到和斩杀的乱军先后足有一千多人，剩余者一时也无法追捕，尤其是斩杀了王国的把总李自成更不知下落。
了点时间安抚住地方，杨肇基派兵继续在附近搜捕乱军，尤其是找寻李自成的下落。同时杨肇基给京师那边上了奏折，仔细说了兵变之事，向朝廷请罪的同时也告诉朝廷，因为兵变缘故，他这边没办法再派部队勤王了。接下来的几日，陆陆续续又搜捕到了些逃散民间的乱军，可始终都没找到李自成的下落。无奈之下，只能发出海捕文书，告知各州府继续捉拿李自成等人。
而这个时候，李自成已经带着他的兄弟们日夜兼程一口气从金县跑到了定西，为了避免被地方察觉，李自成根本就没走官道，行的都是小路或者人迹罕见的区域，他的目标依旧是老家陕西，不管怎么说先跑到陕西再做打算。
李自成在金县杀上官造反，甘肃勤王军还没走出甘肃呢就因为这场兵变烟消云散。
而在京师，明军和皇太极的八旗依旧在作战，自从两军对垒后第一次交手，袁崇焕设下阵法意图引诱八旗兵反而被对方打了个落流水，就连自己也差一点战死当场，接着慌乱之中仓促开炮，非但没有给八旗带来什么伤亡，反而误击了满桂，不仅打死了近百友军，就连满桂也被自己人的火炮给打伤。
这一战后，明军的士气大跌，对八旗的畏惧更甚。虽然崇祯皇帝之后召袁崇焕和满桂入城，在表彰满桂的同时也敲打了袁崇焕一番，可回到城外的袁崇焕却没有按照崇祯皇帝的旨意带兵进攻八旗，反而摆出一副标准的守势。
这倒不是袁崇焕不想打，而是他不敢打。作为蓟辽督师，袁崇焕和八旗交手多年，非常清楚这些建奴的战斗力有多强。虽然他带来的关宁军都是精锐，除去他的部队外，还有宣大的友军，从人数来说并不比八旗兵少，甚至还占有优势。
可袁崇焕却清楚打仗不是仅仅看人数的，如果靠人数就能赢的话那么辽东战事也不会一直到今日未能平定了，建奴野战的战斗力极强，再加上建奴的八旗兵和一同而来的蒙古人都是骑兵，仅靠自己手中这些军队如果仅仅防守绝对没问题，可要野战赢得对方连半分把握都没。
袁崇焕很清楚明军的问题，更明白双方的力量对比，他之所以不主动出击就是考虑到这点，一旦关宁军和宣大军在京师城外再败，那么京师就危险了，如果没有这两支部队的守护，那么京师门洞必然大开，建奴的骑兵可以毫无顾忌地直接进攻京师，到时候袁崇焕如何向崇祯皇帝交代
从这点来说，袁崇焕是求稳，他很清楚皇太极绝对不会在京师多留，只要自己守住京师，不给皇太极可乘之机，那么在根本无法打破京师的情况下，皇太极必然会退兵。
别忘记皇太极和他的八旗兵眼下是在大明的腹地，这里可不是辽东，更不是蒙古草原。虽然皇太极虚晃一枪，借道蒙古趁明军不备一口气打到了京师，可大明依旧占有主动，地方州府和卫所的守军也皆在，更不用说朝廷早就发出了勤王旨意，各地包括九边的边军正连夜朝着京师赶来，一旦各部勤王大军抵达，那么袁崇焕手中就有了足够和八旗抗衡的力量。
等到那时候皇太极不退也得退，如果他再不退，只要明军派一部在蓟州至遵化一线设下拦截堵住缺口，直接切断皇太极退往草原的通道，那么皇太极包括他的八旗就岌岌可危了。
在大明腹地作战，哪怕八旗兵再能打也是无济于事，无根之萍又怕什么假如皇太极不退，袁崇焕有十足的把握把皇太极包括他的八旗全部留在大明。至于皇太极也不傻，他当然也明白这点，所以从正式开战以来八旗并没有全力进攻京师，只是和明军对峙，小规模的战争一直都有，但大规模的交战却除了上次外再也没发生过。
眼下，袁崇焕等的就是各地的勤王部队，而皇太极是抓紧时间掠夺大明腹地，争取在跑路之前多捞点好处。假如继续这样对峙下去，再过些日子，只要各地的勤王部队陆续抵达，明军的力量不断增强，那么皇太极不跑也得跑，要不他就跑不了了。
从战术角度来看，袁崇焕这样的处置并不能说错，因为这种方式在他看来是最为合适的，也是能最小减少明军这边损失的。
能不战而屈人之兵，逼迫皇太极撤退，这不是最好的办法么可这么做也有两个很大的问题，第一个问题就等于直接放弃了京畿其他地方的防御，因为八旗的四处掠夺各地百姓遭了殃，无数百姓的家园被毁，粮食财物被夺，就连人丁也被八旗给直接掳走。
这些老百姓，包括一些小县的官员们，眼睁睁看着凶悍残忍的八旗兵如风一般而过，留下一片狼藉，而自己的军队却连影子都瞧不见，侥幸逃过敌手的百姓们痛哭不已，对手握重兵却一直按兵不动，任凭八旗抢掠的袁崇焕更是恨之入骨。
至于第二个问题就是崇祯皇帝的想法了，崇祯皇帝希望袁崇焕能尽快打退皇太极的大军，解决京师的危机。可等来等去，城外的袁崇焕却没有按照他的意图主动出战，反而一直避战，这让崇祯皇帝不由得对袁崇焕心生怒气。