干掉陈豹，郑芝龙终于出了一口恶气，可正当他为之高兴时，两广总督熊文灿不知从哪里得知了此事，以郑芝龙擅杀朝廷命官为由，直接上书朝廷弹劾郑芝龙。
不仅如此，这件事也很快传到了福建，福建上下得知陈豹死后也皆是大惊，就连闽浙总督洪承畴也派人询问此事，斥问郑芝龙为何要杀陈豹，如郑芝龙只是以上官的名义抓捕陈豹，然后再以正常程序进行处置，无论是国法还是军法都没问题，但郑芝龙却直接派人杀了陈豹，这就性质完全不同了，毕竟陈豹是朝廷命官，堂堂镇国将军，如此级别的官员郑芝龙居然直接下手杀了，还是以这样的手段追杀，着实骇人听闻。
洪承畴身为闽浙总督，掌控闽浙军政，属下居然出了这样的大事他也无法和朝廷交代，再加上熊文灿的弹劾，洪承畴不能无动于衷，直接就向郑芝龙施压，让他说明情况，交出凶手。
此外，由于陈豹的死还引发了一系列的后续，尤其是陈豹之前所在的南澳，南澳本就属于广东的地盘，之前陈豹活着的时候南澳掌控在陈豹手里，换而言之也就是掌控在郑芝龙的手中。而现在陈豹一死，南澳没了主将，熊文灿以两广总督名义直接派人接管了南澳，抢在郑芝龙前头拿回南澳，这一举动更让郑芝龙勃然大怒，要知道南澳的重要性对于郑芝龙集团可以说举足轻重，因为南澳的缘故，郑芝龙的触手才能以南澳为由直接伸向南海，掌控住南海的海上要道，并且为其敛财。
一旦南澳落在熊文灿的手里，郑芝龙要和以前那样继续掌控南海就没那么容易了。虽然郑芝龙的船队依旧在，他的实力也未损失，可失去了南澳这个桥头堡，郑芝龙对南海的掌控力度就会大大减弱，再加上熊文灿以南澳为基卡住了郑芝龙南下南海的要道，使得郑芝龙以后再也无法和以前那样轻易控制住南海了。
这还不算，陈豹的死还引发了郑芝龙内部的人心不稳，所有人都知道陈豹是跟着郑芝龙的老人之一，虽然陈豹的人品不怎么样，可对于郑芝龙却是忠心耿耿，这些年在南澳为郑芝龙掌控南海要道帮助郑芝龙捞了不少银子，这样的一个人郑芝龙居然说杀就杀，这让其他人心中如何想？
郑芝龙仅仅因为所谓的传言，就下狠手杀掉了陈豹，而且斩草除根把陈豹的家眷也一并处置了，这下手也未免太毒辣了。
虽然大家都是海盗出身，是提着脑袋在海上干无本买卖起家的，可问题在于现在所有人都早就被朝廷招安了啊，已去了匪身转为官身了，陈豹的官职不低，军衔也高，以他这样的身份地位依旧保不住性命，更何况其他人呢？
为此，不少人开始人心惶惶，生怕郑芝龙下一个就向自己下手。甚至还有传言说，郑芝龙杀陈豹并非是陈豹要反郑芝龙，而是因为郑芝龙看上了陈豹的银子这才用这种方式动手，而事实也证明了这点，陈豹死后他庞大的家财全部被郑氏兄弟给一口吞了。
一时间各种传言满天飞，郑芝龙根本没预料到会有这样的情况发生，刚刚因为陈豹之死变好的心情一下子就变得糟糕起来，各方面而来的压力让郑芝龙有些无所适从，他只能一方面想办法解决官场上的问题，另一方面还要腾出手来处置郑氏集团内部的问题，以安抚住人心。
可就算这样，也让郑芝龙有些焦头烂额，他万万没想到仅仅只是一个陈豹居然会引发这样的连锁反应，这是他之前没能预判的。此外，就连郑氏三兄弟之间也因为这件事闹起了矛盾，当郑芝豹带人回来之后，郑芝莞就当着他的面直接批评郑芝豹举动太过莽撞，明明有更好的办法处置掉陈豹，为何把此事闹的如此之大呢？
“这也怪我？”郑芝豹不服气道：“老子还没到南澳呢，陈豹这小子就跑了，他这一跑之前的安排全都落了空。而且这小子打定主意投靠熊文灿，一旦让他到了熊文灿那边那还得了？别忘了，陈豹这些年为我们兄弟做了多少事，尤其是南海都是他在负责，手里可有不少秘密，如果把这些全揭出来，你我兄弟能有好？”
“可就算这样也不能大张旗鼓干啊！”郑芝莞埋怨道：“既然你带人截住了陈豹为何要当场斩杀？何不直接把人带回来再说？只要人在手中，什么时候不能杀？用什么手段不能让他死？现在可好，陈豹这样一死，外面的谣言满天飞，两广、闽浙两个总督衙门也要大哥给出解释，一旦朝廷因为此事怪罪下来，你让大哥如何交代？”
郑芝莞对郑芝豹这一次出手对付陈豹的结果极为不满，在他看来明明有更好的解决办法，可郑芝豹偏偏采取了最激烈也是最坏的手段。
按照他们之前商议的计划是郑芝豹以巡察南澳为由前去，然后趁陈豹没有准备控制住南澳，然后再让陈豹自投罗网去见郑芝豹，只要陈豹一出现，郑芝豹就能用手中的兵力直接控住住陈豹，进行抓捕，到时候陈豹就算生了翅膀也逃不过去，最终如何处置还不是轻易之极？
而抓到陈豹是第一步，第二步就是搞清楚陈豹这些年究竟借着南海的“买卖”私下捞了多少银子，让他把这些银子全部给吐出来。等把银子拿到手，陈豹就没了用处，到时候怎么杀都成。