曹爽点头道：“王司空所言不错，像荀令君这样的人物是为我大魏的建立兴起做出过大贡献的，
但荀令君这样的人在世家中是何其的少，荀令君这样的只是风毛菱角罢了，若是如今世家中能有这样的人物，朝廷自会重用之。”
曹爽顿了顿又开口道：“如今世家中更多的还是像当初司马懿这样的狼子野心之辈，这让朝廷如何能对世家之人完全放下戒心？”
当时董卓威陵天下，曹操问计于荀彧，荀彧说：“董卓残暴已经超出常理，一定会因祸乱暴毙，不会有什么作为的。”后董卓派李傕等出关东，虏略各地，至颍川、陈留而归。荀彧乡人多数死于战乱。
初平三年（192年），曹操领兖州牧，后为镇东将军。
荀彧则以司马身份随其征战。荀彧兴平元年（194年），曹操东征徐州牧陶谦，张邈、陈宫乘机在兖州反曹，暗中迎接吕布。
时荀彧和寿张令程昱守鄄城（今山东鄄城北，兖州治所），吕布到后，张邈派刘翊告诉荀彧：“吕将军来帮助曹使君进攻陶谦，应该马上供给他们军备粮食。”
众人疑惑，唯荀彧知其计，立即命令军队加强防，并急召东郡太守夏侯惇。而兖州诸城皆响应张邈，投靠吕布阵营。
当时曹操率大军出征，留守的兵力很少，而且很多人都与张邈、陈宫勾结。
夏侯惇到后，乘夜诛杀谋反者数十人，军心乃安。
豫州刺史郭贡受吕布煽动，率众数万来攻，军中甚惧。
郭贡要求见荀彧，荀彧准备前往，夏侯惇等人说：“您是一州的屏障，如果前往一定会有危险的，不可以去。”
荀彧说：“郭贡与张邈他们，平素并没有什么往来，现在来得急，计划肯定还没有定下；现在趁他计策未定来游说，就算不能帮助我们，也可以使他保持中立，如果先怀疑，那他就会恼怒而定计了。”
于是出城会见郭贡，郭贡见荀彧毫无惧意，认为鄄城易守难攻，引兵而去。
荀彧又与程昱定计，保全了范、东阿。卒全三城。不久，曹操回师濮阳击败了吕布。
兴平二年（195年）正月，曹操击败侵入定陶（今山东定陶西北）的吕布军。
五月，曹操向驻军巨野（今山东巨野东北）的吕布部将薛兰、李封发动攻击，吕布亲自援救，被曹操击败，撤退而走。曹操歼灭巨野守军，斩薛兰、李封，乘胜进驻乘氏（今山东巨野西南）。
此时，陶谦已死，曹操获悉后，打算趁机夺取徐州，再回军消灭吕布。
荀彧劝阻说：“当年汉高祖保守关中，光武帝占据河内，都是先巩固基地以控制天下，这样进可以制胜，退可以固守，所以虽有困难曲折却最终能完成大业。