立夏过后，雾灵镇突然流行起一种怪病。患者先是咳嗽不止，痰中带血，继而全身长出鱼鳞状红斑，最后竟会在痛苦中化作齑粉。林秋接诊的第七个患者是镇东的王婶，她手腕内侧的红斑已连成一片，形如酸角树叶，按压时竟发出沙沙异响。
「这不是普通的皮肤病，」林秋用银针挑破红斑，挤出的不是脓血，而是酸角核碎屑，「是『化骨核毒』。」阿楠翻开《毒经》残页，果然找到相关记载：「化骨核毒，以酸角核磨粉为引，混入饮食，百日发作，发作时骨肉成核，七窍流血而亡。」
更诡异的是，所有患者都曾在「同春堂」药铺买过止咳药。林秋带着阿楠查访药铺，发现掌柜正在往药粉里掺入细如尘埃的酸角核粉。面对质问，掌柜突然口吐黑血暴毙，手中紧攥着刻有「永」字的药包——与二十年前密室中骸骨手里的药包一模一样。
「同春堂是毒雕门的据点！」阿楠踢翻药柜，露出底下的暗格，格中整齐码放着刻有患者生辰八字的酸角核，核面「死」字纹路与王婶腕上的红斑完全吻合。林秋取来验毒酸角，叶片触到核粉瞬间焦黑，显影出「千骨核阵」四个字——这是毒雕门用百人骸骨炼制的邪毒。
回到医馆，林秋连夜研制解药。他发现，化骨核毒的弱点在于酸角核的「木性」，若用金性药材克制，或能破解。阿楠按照《本草纲目》配比，将穿山甲鳞片、自然铜等金石药与酸角汁混合，熬出呈金色的「破核汤」。
破晓时分，王婶突然病情恶化，红斑蔓延至胸口，咳出的核碎屑中竟混着碎骨。林秋当机立断，用「火针疗法」刺入她的「肺俞穴」「肾经穴」，针尾烧红的金艾条与破核汤共鸣，竟在她体内发出金石相击之声。阿楠趁机喂下汤药，王婶腹中传来一阵轰鸣，咳出大量酸角核粉，其中夹杂着半枚刻有「王」字的核雕。
「这是毒雕门的『命核』，」林秋捏碎核雕，里面掉出张纸条，「『永阁秘药现世，千骨阵成，鸡犬不留』。」他突然想起鹰嘴崖的阴尸案，毒雕门接连作案，恐怕是想通过邪术逼他交出《毒经》全本。
当日正午，雾灵镇突然来了个游方郎中。此人头戴宽檐帽，腰间挂着酸角核串成的辟邪链，自称能治百病。林秋注意到他袖口露出的狼头刺青，正是毒雕门的标记，便不动声色地观察他如何施针。
游方郎中用的是「透骨针法」，看似治疗咳嗽，实则在患者「大椎穴」埋下酸角核粉。林秋假装请教，趁其不备点了他的哑穴，从其药箱中搜出三十枚刻有「病」字的核雕。阿楠认出，这些核雕与同春堂暗格中的形制一致，显然是用来操控患者的邪器。
「说，千骨核阵的阵眼在哪里？」林秋逼问。郎中虽不能说话，却用眼神瞥向镇北的「善人庙」。两人赶到时，庙中已摆好九十九具棺材，每具棺材上都刻着「永」字，中央的空棺前供着《毒经》残页的影印本。
「林秋，你果然来了。」灰衣人从梁上跃下，正是二十年前灭门惨案的幸存者之一，「当年你师父藏起《毒经》全本，现在该物归原主了。」他挥手掷出毒针，针尖泛着冰蟾毒特有的幽蓝。林秋挥袖扫落毒针，袖中带出的破核汤洒在棺木上，竟腐蚀出「邪」字痕迹。
灰衣人见势不妙，点燃阵眼处的酸角核粉。瞬间，九十九具棺材同时开启，里面竟全是用酸角木雕成的傀儡，每个傀儡心口都嵌着患者的命核。林秋迅速布下「五行相克阵」，用金石药克制木性核毒，阿楠则将验毒酸角的藤蔓缠上傀儡，藤蔓遇毒开花，显影出「解」字光芒。
傀儡群在光芒中崩解，露出底下的地道。地道尽头是个密室，墙上挂着毒雕门历代门主的画像，最新的一幅竟与林秋有七分相似。阿楠惊呼：「师父，这是……」「是我爹。」林秋握紧拳头，终于明白为何毒雕门穷追不舍——他身上流着毒雕门门主的血，而《毒经》全本，恐怕就藏在他的血脉之中。
密室中央的石台上，摆着个酸角木盒，盒中放着半枚刻有「毒」字的玉佩。林秋刚触碰玉佩，脑海中竟浮现出儿时记忆：父亲抱着他站在酸角树下，手中拿着《毒经》全本，笑着对他说：「秋儿，记住，医毒本同源，关键在人心。」
灰衣人趁机偷袭，毒针直指林秋后心。阿楠奋不顾身扑上去挡住针，鲜血溅在酸角木盒上，竟激活了盒底的机关。盒中升起一卷羊皮书，正是失踪多年的《毒经》全本，书页上用父亲的笔迹写着：「吾儿切记，以医道为骨，以仁心为魂，方破万毒。」
林秋含泪接过医书，验毒酸角突然疯长，藤蔓缠住灰衣人，显影出他心中的记忆：原来他也是毒雕门的受害者，家人被门主害死，被迫修炼邪术。「你走吧，」林秋解开他的穴道，「毒雕门的恩怨，不该由你我延续。」
雾灵镇的暮色中，林秋烧毁了所有命核，验毒酸角开出的白花铺满善人庙。王婶带着康复的镇民来谢恩，他们腕上的红斑已化作淡粉色的酸角叶形胎记，竟成了辟邪的印记。阿楠的伤在「破核汤」的救治下日渐好转，他摸着胸前的酸角核吊坠，问：「师父，《毒经》全本怎么办？」
林秋望向医馆后院的酸角树，月光透过树叶，在《毒经》封面上投出「医」字光影。他取出毛笔，在扉页写下：「以毒为鉴，以医为剑，斩尽邪祟，方得永年。」写完，他将书锁进密室，钥匙藏在酸角树的树洞深处——那里，还放着父亲遗留的半枚玉佩，与他颈间的半枚严丝合缝。
深夜，永阁医馆的灯笼亮起，灯光穿过刻有「永」字的窗棂，在地上投出「安」字。林秋坐在药柜前，细细研磨着能解百毒的酸角膏，这次他要炼的，是能根治化骨核毒的「永宁膏」。他知道，毒雕门的阴谋不会就此终结，但只要他守住医者的本心，雾灵镇的天空，终将云开月明。