虽然慈航真人与观音菩萨在法相上看来如出一辙，但是在道教看来，慈航真人与观音菩萨根本就是截然不同的两个人。
举个简单的例子。
性别。
对于道教来说，慈航道人是道家女真神仙，修道成仙前本就是女人。
根据《历代神仙通鉴》记载，在普陀落伽岩潮音洞中有一位女真君，相传在商王时就在此修道，已习得神通三昧，发愿要普度天下男女。经常用丹药和甘露水救济百姓，南海人都称她为慈航大士。
古经《灵宝经》里记载说慈航道人原为禅黎世界坠王的小女儿，都到了四岁了还是不会说话，坠王觉的非常奇怪，不喜，就将她丢弃于南浮桑之阿空山之中。山中没有粮食，年纪小又不会采摘和捕猎，但是却能吞食日月精华。
根据古书记载可知，慈航道人本来就是女性，这与佛教不同，在佛教流行观点中，观音菩萨原本是男儿身，后来化作女儿身的。
另外还有一个很明显的不同点。
时间。
道教是中国土生土长的宗教，其有典可查的历史就有四千多年。根据《历代神仙通鉴》记载，慈航真人在商王时就已经修道成仙；另外《封神演义》记载的是商之纣王时期，慈航真人为元始天尊门下十二金仙之一，排名第三。
据此可知，慈航真人最迟在商末周初就已经存在于中国历史了，而佛教最早产生于汉朝时期，大约在在公元前400-500年之间，传入中国的时间大约在东汉时期，所以观音菩萨最早也只是在汉朝才出现在历史中。
另外两者的法相也是有区别的，寺庙奉的观音菩萨的神像，在其胸口位置会有一个“卍”字的佛家标记，而道观奉的慈航道人的神像则断然没有。
听到小太监说到慈航真人，想到佛道两教宗教信仰，朱平安就大约猜到嘉靖帝心情不好的原因了。
果然。
下一秒小太监说的话，也证实了朱平安心中的猜测。
“巧了的是，六月十九也是观世音菩萨成道的日子。昨日，圣上差锦衣卫去民间采风，看看民间百姓是如何过慈航真君成道日的，看看慈航真君的香火可还好。可是民间这些个愚昧的百姓，‘家家弥陀佛、户户观世音’，绝大多数都在求拜观音菩萨，甚少有求拜慈航真君的，寺庙的香火如火如荼，可是道观的香火却不尽如人意”
小太监凑近朱平安耳边说道，眉毛微皱，脸上一副不忿的表情，声音也是埋怨不已。
“你说这些个愚昧无知的，他们让圣上多伤心呐，圣上为了他们，日日夜夜修道、斋醮祈福，向上天祈求消除减轻自然灾害，祈求国泰民安，还不都是为了这些个愚昧不堪的，圣上有多少个祈福的不眠之夜呢，你说他们倒好，受着圣上祁来福气，却一个个白眼狼似的拜观音！”
小太监很是为嘉靖帝抱打不平，说到民间百姓拜观音不拜慈航真君的时候，恨不得要啐他们一脸的架势。
“所以说，就是因为这事让圣上心情很是糟糕，今早被宣到永寿宫的严首辅、徐阁老等大人，还有留在无逸殿的大人，都是因为这事在奋笔疾书呢。”小太监这才言归正传，“所以说，刚刚不给朱大人通传，正是为了朱大人好。”
“平安再次谢过公公了。”朱平安拱手道谢，明白前因后果后，心中已经有了主意。