公海舰队总共拥有三型6艘航空母舰、两型4艘战列舰、三型15艘重巡洋舰、三型15艘轻巡洋舰、62艘Z型驱逐舰以及115艘U型潜艇。
而北方舰队则是拥有1艘重巡洋舰、3艘轻巡洋舰以及7艘Z型驱逐舰。
相比于陆军和空军的变化，海军并没有多大的发展，唯一的改变就是海军航空兵部队研发并装备了全新的飞机。
战斗机从原本由路基ME109改过来的ME109T换为了由道尼尔公司专门为航母研发的DO.38式战斗机。
DO.38相比ME109T，采用了大马力发动机和大螺旋桨以增强性能，然而这样一来就不得不加长起落架以避免大螺旋桨刮到甲板上，但是如果加长了起落架又会带来另一个问题——过长的起落架会导致强度不够，在降落时容易折断。
为了解决这一问题，DO.38的机翼采用了类似于JU87的倒鸥翼式布局，用机翼上的“倒V”补偿了起落架长度，解决了这个问题。
不止于此，采用倒鸥翼式布局的DO.38战斗机相比不采用的ME109T，在升力和飞行员视野方面也得到了显着提升。
不过海军航空兵最需要改进的不是战斗机方面，而是俯冲轰炸机和鱼雷攻击机。
在西班牙内战的时候，德军航母部队总共损失了40多架JU87C俯冲轰炸机和20多架FI-167鱼雷攻击机，暴露了很多的缺点。
JU87C的缺点是因为是由路基改来的，所以在起飞和降落时的视野都很受限，这导致了损失的所有JU87C里，有一多半都是非战损损失。
而FI-167的缺点则更加致命，它作为一架双翼飞机，注定了它的生存性能低下，连西班牙那种可有可无的防空火力都能给FI-167带来巨大的杀伤，更不用说未来它所要面对的英国皇家海军了。
认识到这些缺点的德军立即下令为航母专门研制新的俯冲轰炸机和鱼雷攻击机。
所以在DO.38大规模装备德军航母的同时，新的两款战机也同时装备了海军。
新的舰载攻击机由容克公司制造，被命名为JU90，它在大体外形上和JU87C的区别不大，一样采用的是倒鸥翼式机翼布局，与JU87相比做出的改变主要集中于起落架和座舱。
而新的鱼雷攻击机则由FW190的生产商福克·沃尔夫飞机制造厂所研制，它被命名为FW200。
FW200在外形以及性能上都类似于日本的“流星”舰载鱼雷攻击机。
FW200生产工艺简单，主翼和DO.38一样为倒鸥型。福克·沃尔夫公司为了提升它的鱼雷攻击能力，还为其设计了特有的双重襟翼与副翼襟翼联动，用以提升低速性能。
在作战方面，它不但可以担负鱼雷攻击任务，还可以兼职俯冲轰炸任务，另外由于它拥有相当优异的气动外形，所以在必要时还可以与敌方战斗机格斗，当然，这种情况很难出现。
总的来说，海军虽然在舰船数量方面没有大的变化，但是在海军航空兵实力方面，进步非常之大。